Občutljivost hitrih testov, seroloških in molekularnih tehnik za detekcijo virusa šarke v različnih tkivih

Mojca VIRŠČEK MARN, Irena MAVRIČ PLEŠKO, Denise ALTENBACH, Walter BITTERLIN

Povzetek


Občutljivost hitrih testov (AgriStrip in Immunochromato), DAS-ELISA, dvostopenjske RT-PCR in RT-PCR v realnem času za detekcijo virusa šarke (Plum pox virus, PPV) smo proučevali v različnih tkivih dreves marelice, breskve, slive in cibore, okuženih z izolati PPV-D, PPV-M ali PPV-Rec. Ti trije različki so potrjeno  navzoči v Sloveniji. Vzorci cvetov marelice in slive, odvzeti v času polnega cvetenja, so bili zelo primerni za detekcijo PPV. V delih listov z znaki okužbe je bila detekcija uspešna z vsemi  tehnikami v maju in z eno izjemo tudi v avgustu. S hitrimi testi, DAS-ELISA in delno tudi z molekularnimi tehnikami nismo uspeli detektirati virusa šarke v listih brez znakov okužbe. S hitrimi testi in DAS-ELISA smo navzočnost PPV potrdili le v delu vzorcev iz asimptomatičnih delov listov z znaki okužbe in iz listnih pecljev ter v nobenem vzorcu brstov v avgustu. Hitri testi so torej primerni le za potrditev okužbe s PPV v listih z znaki okužbe. Če znaki okužbe niso vidni, je potrebno DAS-ELISA kombinirati ali nadomestiti z molekularnimi tehnikami.

Ključne besede


šarka; virusi; detekcija; molekularne tehnike; serološke tehnike; hitri testi; DAS-ELISA; RT-PCR; RT-PCR v realnem času

Celotno besedilo:

PDF (English)

Literatura


EPPO 2004. Plum pox potyvirus. EPPO Bulletin. 34 , 247–256, DOI: 10.1111/j.1365-2338.2004.00726.x.

Adams A.N., 1978. The detection of Plum pox virus in Prunus species by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Annals of Applied Biology 90: 215-221, DOI: 10.1111/j.1744- 7348.1978.tb02629.x.

Candresse T., M. Cambra, S. Dallot, M. Lanneau, M. Asensio, M.T. Gorris, F. Revers, G. Macquaire, A.Olmos, D. Boscia, J.B. Quiot, J. Dunez, 1998. Comparison of monoclonal antibodies and PCR assays for the typing of isolates belonging to the D and M serotypes of Plum Pox Potyvirus. Phytopathology 88: 198-204, DOI : 10.1094/PHYTO.1998.88.3.198.

Dosba F., M. Lansac, G. Pecheur, B. Teyssier, J.-P. Piquemal, M. Michel, 1986. Plum pox virus detection by ELISA technique in peach and apricot infected at different growing stages. Acta Horticulturae 193: 187-191

Hartmann W. 1999. Breeding of plum cultivars resistant to Plum pox virus . Acta Horticulturae, 484: 487- 490

Hamford G. 1982. The detection of Plum pox virus (PPV) by indicator plants and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Acta Horticulturae 130: 151- 159

Kamenova I., S. Milusheva, 2005. Sharka disease in Bulgaria: past, present and future. Biotechnol. & Biotechnol. Eq 19, Special Issue: 22-40 http://www.diagnosisp.com/dp/journals/view_pdf.p hp/?journal_id=1&archive=0&issue_id=8&article_i d=223 (July 2012)

Mavrič Pleško I., M. Viršček Marn, N. Toplak, 2011. Total RNA extraction method and Prunus species infulence the detection of Plum pox potyvirus by real-time RT-PCR. Acta agriculturae Slovenica 97: 105-113.

Myrta A., O. Potere, F. Ismaeil, D. Boscia, 2003. The distribution of Prunus: experiences of diagnosis with ELISA. Options Méditerranéennes. Série B : Etudes et Recherches 45: 107-110

Németh M. 1986. Virus, mycoplasma and rickettsia like diseases of fruit trees. Ak ademia Kiado, Budapest, Hungary, 841 pp.

Neumüller M., W. Hartmann, 2008. The hypersensitivity of european plum (Prunus domestica L.) against the Plum pox virus. Acta Horticulturae 781: 273-279

Polák J. 2008. Characterisati on of different interactions between cultivars of stone fruits and Plum pox virus. Acta Horticulturae 781: 287-293

Szathmáry E., L. Palkovics, 2010. Natural deletion is not unique in the coat protein (CP) of recombinant Plum pox virus (PPV) isolates in Hungary. Julius-Kühn-Archi , 427: 151-155

Wetzel T., T. Candresse, M. Ravelonandro, J. Dunez, 1991. A polymerase chain reaction assay adapted to Plum pox potyvirus detection. Journal of Virological Methods 33: 355-365, DOI: 10.1016/0166-0934(91)90035-X




DOI: http://dx.doi.org/10.14720/aas.2014.103.1.13

Povratne povezave

  • Trenutno ni nobenih povratnih povezav.


Avtorske pravice (c) 2014 Acta agriculturae Slovenica

 

Acta agriculturae Slovenica je odprtodostopna revija, ki objavlja pod pogoji licence Creative Commons Priznanje avtorstva (CC BY).

                     


eISSN 1854-1941